Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sae1Q9R1T2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sae1Q9R1T2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sae1Q9R1T2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sae1Q9R1T2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sae1Q9R1T2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sae1Q9R1T2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms