Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q1

Sytl4, Synaptotagmin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl4Q9R0Q1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sytl4Q9R0Q1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sytl4Q9R0Q1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sytl4Q9R0Q1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sytl4Q9R0Q1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sytl4Q9R0Q1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sytl4Q9R0Q1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sytl4Q9R0Q1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sytl4Q9R0Q1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms