Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpxQ9R0M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpxQ9R0M3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpxQ9R0M3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrpxQ9R0M3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms