Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkab1Q9R078 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkab1Q9R078 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkab1Q9R078 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkab1Q9R078 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prkab1Q9R078 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkab1Q9R078 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms