Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fhl3Q9R059 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fhl3Q9R059 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fhl3Q9R059 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fhl3Q9R059 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fhl3Q9R059 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms