Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc39a1Q9QZ03 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc39a1Q9QZ03 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc39a1Q9QZ03 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc39a1Q9QZ03 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms