Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdh11Q9QYF1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh11Q9QYF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh11Q9QYF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rdh11Q9QYF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh11Q9QYF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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