Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VapbQ9QY76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VapbQ9QY76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VapbQ9QY76 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VapbQ9QY76 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VapbQ9QY76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms