Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkp3Q9QY23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkp3Q9QY23 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp3Q9QY23 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp3Q9QY23 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp3Q9QY23 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms