Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Jag1Q9QXX0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Jag1Q9QXX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Jag1Q9QXX0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Jag1Q9QXX0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Jag1Q9QXX0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Jag1Q9QXX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Jag1Q9QXX0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jag1Q9QXX0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jag1Q9QXX0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms