Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx8Q9QXV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx8Q9QXV1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cbx8Q9QXV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx8Q9QXV1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx8Q9QXV1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms