Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg2Q9QXK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copg2Q9QXK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copg2Q9QXK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copg2Q9QXK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copg2Q9QXK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copg2Q9QXK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms