Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Homer2Q9QWW1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Homer2Q9QWW1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Homer2Q9QWW1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Homer2Q9QWW1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Homer2Q9QWW1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms