Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slamf1Q9QUM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slamf1Q9QUM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slamf1Q9QUM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slamf1Q9QUM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slamf1Q9QUM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slamf1Q9QUM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slamf1Q9QUM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slamf1Q9QUM4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms