Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrac1Q9JKP8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrac1Q9JKP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrac1Q9JKP8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrac1Q9JKP8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrac1Q9JKP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms