Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfhx4Q9JJN2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfhx4Q9JJN2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfhx4Q9JJN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfhx4Q9JJN2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms