Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb9Q9JJ59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb9Q9JJ59 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb9Q9JJ59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms