Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT1

Rnf32, RING finger protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf32Q9JIT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf32Q9JIT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf32Q9JIT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf32Q9JIT1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf32Q9JIT1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf32Q9JIT1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms