Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ercc6l2Q9JIM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ercc6l2Q9JIM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ercc6l2Q9JIM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ercc6l2Q9JIM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6l2Q9JIM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms