Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Tulp4Q9JIL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Tulp4Q9JIL5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tulp4Q9JIL5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Tulp4Q9JIL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tulp4Q9JIL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Tulp4Q9JIL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tulp4Q9JIL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tulp4Q9JIL5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Tulp4Q9JIL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms