Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copb1Q9JIF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copb1Q9JIF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copb1Q9JIF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copb1Q9JIF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copb1Q9JIF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms