Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EefsecQ9JHW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EefsecQ9JHW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EefsecQ9JHW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EefsecQ9JHW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms