Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcirg1Q9JHF5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcirg1Q9JHF5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcirg1Q9JHF5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcirg1Q9JHF5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms