Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM6

Gdpd2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd2Q9ESM6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdpd2Q9ESM6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdpd2Q9ESM6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gdpd2Q9ESM6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gdpd2Q9ESM6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gdpd2Q9ESM6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gdpd2Q9ESM6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdpd2Q9ESM6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms