Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb2Q9ERK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb2Q9ERK7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrnb2Q9ERK7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrnb2Q9ERK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrnb2Q9ERK7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrnb2Q9ERK7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrnb2Q9ERK7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms