Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Irx6Q9ER75 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx6Q9ER75 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Irx6Q9ER75 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Irx6Q9ER75 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Irx6Q9ER75 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Irx6Q9ER75 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Irx6Q9ER75 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms