Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf23Q9ER63 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf23Q9ER63 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf23Q9ER63 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms