Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf8Q9EQH4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf8Q9EQH4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf8Q9EQH4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf8Q9EQH4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms