Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms