Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv4Q9EPK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv4Q9EPK8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpv4Q9EPK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv4Q9EPK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv4Q9EPK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.3 ms