Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GabarapQ9DCD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GabarapQ9DCD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GabarapQ9DCD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GabarapQ9DCD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms