Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde1Q9DBZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syde1Q9DBZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syde1Q9DBZ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syde1Q9DBZ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syde1Q9DBZ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms