Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf138rt1Q9D9M9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf138rt1Q9D9M9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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Rnf138rt1Q9D9M9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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Rnf138rt1Q9D9M9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf138rt1Q9D9M9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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