Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms