Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg7Q9D906 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg7Q9D906 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg7Q9D906 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg7Q9D906 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg7Q9D906 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms