Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Derl3Q9D8K3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Derl3Q9D8K3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Derl3Q9D8K3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Derl3Q9D8K3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms