Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Chmp5Q9D7S9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp5Q9D7S9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp5Q9D7S9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chmp5Q9D7S9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp5Q9D7S9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Chmp5Q9D7S9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms