Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Klhl40Q9D783 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl40Q9D783 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl40Q9D783 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klhl40Q9D783 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhl40Q9D783 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms