Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf13Q9D777 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfsf13Q9D777 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfsf13Q9D777 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13Q9D777 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms