Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Exosc8Q9D753 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Exosc8Q9D753 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Exosc8Q9D753 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Exosc8Q9D753 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Exosc8Q9D753 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms