Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nsmce1Q9D720 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsmce1Q9D720 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsmce1Q9D720 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsmce1Q9D720 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms