Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc7Q9D541 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc7Q9D541 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc7Q9D541 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc7Q9D541 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc7Q9D541 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc7Q9D541 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc7Q9D541 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms