Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rabl3Q9D4V7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabl3Q9D4V7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabl3Q9D4V7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabl3Q9D4V7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabl3Q9D4V7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabl3Q9D4V7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms