Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2al3Q9D4U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al3Q9D4U4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al3Q9D4U4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms