Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931423N10RikQ9D4J9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4931423N10RikQ9D4J9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4931423N10RikQ9D4J9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4931423N10RikQ9D4J9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms