Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lonrf3Q9D4H7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lonrf3Q9D4H7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lonrf3Q9D4H7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms