Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933414I15RikQ9D4D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933414I15RikQ9D4D5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933414I15RikQ9D4D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933414I15RikQ9D4D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms