Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap53Q9D439 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap53Q9D439 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap53Q9D439 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap53Q9D439 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms