Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trmt44Q9D2Q2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trmt44Q9D2Q2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trmt44Q9D2Q2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trmt44Q9D2Q2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt44Q9D2Q2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms