Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisal2bQ9D1Y9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisal2bQ9D1Y9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisal2bQ9D1Y9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms