Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0S4

Neurl2, Neuralized-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl2Q9D0S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurl2Q9D0S4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl2Q9D0S4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl2Q9D0S4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Neurl2Q9D0S4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neurl2Q9D0S4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neurl2Q9D0S4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neurl2Q9D0S4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neurl2Q9D0S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms